Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMC3IPQ9P2W1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms