Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP28Q9P2N2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms