Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDH10Q9P2E7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms