Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC88CQ9P219 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC88CQ9P219 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms