Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALCOCO1Q9P1Z2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CALCOCO1Q9P1Z2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms