Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHRF1Q9P1Y6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHRF1Q9P1Y6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms