Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSRB1Q9NZV6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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