Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDX56Q9NY93 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX56Q9NY93 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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