Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDND1Q9NY35 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms