Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDAP2Q9NXN4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDAP2Q9NXN4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDAP2Q9NXN4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms