Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TOR4AQ9NXH8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TOR4AQ9NXH8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms