Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC6A13Q9NSD5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A13Q9NSD5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms