Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DUOX2Q9NRD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUOX2Q9NRD8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms