Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTBN5Q9NRC6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN5Q9NRC6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms