Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XPNPEP3Q9NQH7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms