Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNK9Q9NPC2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms