Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA1Q9NP55 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BPIFA1Q9NP55 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BPIFA1Q9NP55 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA1Q9NP55 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA1Q9NP55 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms