Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1LQ9HCJ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1LQ9HCJ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms