Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4Q9HBW1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4Q9HBW1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms