Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ROPN1Q9HAT0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ROPN1Q9HAT0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms