Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD3Q9H7B4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms