Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R7

WDCP, WD repeat and coiled-coil-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDCPQ9H6R7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDCPQ9H6R7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDCPQ9H6R7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms