Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EBF3Q9H4W6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF3Q9H4W6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms