Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM12Q9H4Q4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms