Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX5Q9H2C1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms