Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms