Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms