Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP44Q9C0F1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms