Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LNPKQ9C0E8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LNPKQ9C0E8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LNPKQ9C0E8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms