Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2OQ9C0C9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2OQ9C0C9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2OQ9C0C9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms