Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CELF4Q9BZC1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms