Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC2Q9BYS8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC2Q9BYS8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms