Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PCGF6Q9BYE7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PCGF6Q9BYE7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms