Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC8Q9BY41 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HDAC8Q9BY41 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms