Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PRXQ9BXM0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRXQ9BXM0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRXQ9BXM0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRXQ9BXM0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRXQ9BXM0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRXQ9BXM0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms