Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDCA4Q9BXL8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms