Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HIRIP3Q9BW71 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIRIP3Q9BW71 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms