Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms