Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM208Q9BTX3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM208Q9BTX3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms