Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDFIP1Q9BT67 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDFIP1Q9BT67 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms