Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNPY3Q9BT09 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY3Q9BT09 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms