Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C2orf88Q9BSF0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C2orf88Q9BSF0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms