Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AGMATQ9BSE5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AGMATQ9BSE5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms