Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG101Q9BSB4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms