Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPATA25Q9BR10 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPATA25Q9BR10 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms