Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA3Q9BQP9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms