Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOPXQ9BPY8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOPXQ9BPY8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms