Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF15Q99988 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF15Q99988 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms