Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRG3Q99928 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRG3Q99928 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms