Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms